En mina Marlin se manejan diferentes sistemas para la separación de los desechos generados en sus operaciones, ejemplo: basura común, trapos con aceite, plásticos, baterías, llantas, chatarra y desechos orgánicos, con estos se últimos genera “compost”

Otro residuo sólido es el suelo mezclado con hidrocarburos (aceite quemado que resulta de los cambios de aceite de los vehículos pequeños y maquinaria pesada), el cual es depositado en la  cancha de bio-remediación, donde se mezcla con bacterias, generadas en la mina por medio de estiércol de ganado y abono triple 15, para formar un compostaje.